Hi,
I am trying to import the attached Sparky style peak list into my N15
Noesy spectrum and get the following error. Any suggestions?
Thanks,
Aleks
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# FormatConverter: executing readPeaks #
########################################
Exception in thread Thread-1:
Traceback (most recent call last):
File
"/scratch/LOCAL/CCPN/ccpnmr/python2.4/lib/python2.4/threading.py", line
442, in __bootstrap
self.run()
File
"/scratch/LOCAL/CCPN/ccpnmr/ccpnmr1.0/python/ccpnmr/format/gui/ImportExportFormatPopup.py",
line 91, in run
self.returnValue = self.__target(*self.__args, **self.__kwargs)
File
"/scratch/LOCAL/CCPN/ccpnmr/ccpnmr1.0/python/ccpnmr/format/converters/DataFormat.py",
line 2085, in readPeaks
self.setPeaks()
File
"/scratch/LOCAL/CCPN/ccpnmr/ccpnmr1.0/python/ccpnmr/format/converters/DataFormat.py",
line 7241, in setPeaks
self.setPeakDims()
File
"/scratch/LOCAL/CCPN/ccpnmr/ccpnmr1.0/python/ccpnmr/format/converters/DataFormat.py",
line 7343, in setPeakDims
self.setPeakDimResonance()
File
"/scratch/LOCAL/CCPN/ccpnmr/ccpnmr1.0/python/ccpnmr/format/converters/DataFormat.py",
line 7391, in setPeakDimResonance
self.getPeakResNames()
File
"/scratch/LOCAL/CCPN/ccpnmr/ccpnmr1.0/python/ccpnmr/format/converters/SparkyFormat.py",
line 461, in getPeakResNames
assign = self.rawPeak.assign[self.rawPeakDimIndex]
IndexError: list index out of range
Assignment w1 w2 w3
?-?-? 110.769 2.008 8.402
?-?-? 110.769 2.197 8.402
?-?-? 110.769 3.903 8.402
?-?-? 110.769 8.198 8.402
?-?-? 120.514 8.402 8.198
?-?-? 123.462 4.688 8.690
?-?-? 123.462 2.041 8.690
?-?-? 123.462 2.186 8.690
?-?-? 123.462 1.880 8.690
?-?-? 123.462 2.869 8.690
?-?-? 123.462 3.009 8.690
?-?-? 123.462 7.111 8.690
?-?-? 123.462 7.963 8.690
?-?-? 127.826 8.690 7.963
?-?-? 128.715 5.254 9.237
?-?-? 128.715 3.009 9.237
?-?-? 122.719 7.111 9.112
?-?-? 130.516 7.111 9.637
?-?-? 128.715 7.111 9.237
?-?-? 127.826 7.348 7.963
?-?-? 127.826 3.783 7.963
?-?-? 127.826 3.402 7.963
?-?-? 127.826 7.537 7.963
?-?-? 111.178 7.963 7.537
?-?-? 127.826 9.237 7.963
?-?-? 128.715 7.963 9.237
?-?-? 111.178 1.824 7.537
?-?-? 111.178 1.983 7.537
?-?-? 111.178 3.543 7.537
?-?-? 111.178 5.699 7.537
?-?-? 111.178 2.887 7.537
?-?-? 127.731 6.717 9.315
?-?-? 130.516 5.096 9.637
?-?-? 130.516 0.990 9.637
?-?-? 130.516 7.656 9.637
?-?-? 117.229 9.637 7.656
?-?-? 130.516 6.340 9.637
?-?-? 128.715 9.370 9.237
?-?-? 127.423 9.237 9.370
?-?-? 128.715 4.863 9.237
?-?-? 128.715 0.692 9.237
?-?-? 127.423 3.184 9.370
?-?-? 127.423 9.453 9.370
?-?-? 122.056 9.370 9.453
?-?-? 127.423 1.720 9.370
?-?-? 127.423 1.148 9.370
?-?-? 122.056 1.653 9.453
?-?-? 122.056 1.515 9.453
?-?-? 123.352 1.515 9.935
?-?-? 121.642 4.847 8.681
?-?-? 124.969 0.876 8.965
?-?-? 124.969 0.858 8.965
?-?-? 124.969 3.648 8.965
?-?-? 124.969 8.220 8.965
?-?-? 118.092 8.965 8.220
?-?-? 110.651 7.998 8.597
?-?-? 122.006 8.597 7.998
?-?-? 112.350 1.782 7.475
?-?-? 112.350 2.057 7.475
?-?-? 112.350 2.057 6.624
?-?-? 118.190 2.057 7.823
?-?-? 118.190 2.275 7.823
?-?-? 118.190 8.549 7.823
?-?-? 122.563 7.823 8.549
?-?-? 110.950 1.745 7.788
?-?-? 110.950 1.745 6.854
?-?-? 110.950 1.859 7.788
?-?-? 110.950 1.859 6.854
?-?-? 121.642 2.427 8.681
?-?-? 110.950 8.549 7.788
?-?-? 122.563 7.788 8.549
?-?-? 110.950 1.322 7.788
?-?-? 110.950 0.639 7.788
?-?-? 110.950 0.639 6.854
?-?-? 113.485 2.532 8.054
?-?-? 113.485 2.532 7.102
?-?-? 121.642 7.102 8.681
?-?-? 113.485 8.681 7.102
?-?-? 103.446 4.726 9.048
?-?-? 130.256 1.608 10.048
?-?-? 118.092 0.882 8.220
?-?-? 130.256 0.639 10.048
?-?-? 122.056 0.545 9.453
?-?-? 124.418 8.054 8.224
?-?-? 113.485 8.224 8.054
?-?-? 124.418 7.102 8.224
?-?-? 113.485 8.224 7.102
?-?-? 124.418 4.896 8.224
?-?-? 124.418 10.048 8.224
?-?-? 130.256 8.224 10.048
?-?-? 124.418 6.719 8.224
?-?-? 113.485 5.252 8.054
?-?-? 113.485 5.252 7.102
?-?-? 113.485 2.079 8.054
?-?-? 113.485 2.079 7.102
?-?-? 113.485 2.037 7.102
?-?-? 122.056 5.404 9.453
?-?-? 122.056 3.927 9.453
?-?-? 119.799 1.766 9.100
?-?-? 105.470 0.967 7.154
?-?-? 120.726 0.774 8.092
?-?-? 126.720 1.148 9.716
?-?-? 126.720 2.490 9..716
?-?-? 126.720 4.373 9.716
?-?-? 123.352 3.455 9.935
?-?-? 123.352 1.148 9.935
?-?-? 121.797 1.868 8.763
?-?-? 117.229 8.323 7.656
?-?-? 117.003 7.656 8.323
?-?-? 117.229 4.933 7.656
?-?-? 125.631 5.831 8.604
?-?-? 125.299 6.340 8.957
?-?-? 117.003 0.785 8.323
?-?-? 117.003 4.814 8.323
?-?-? 117.003 2.687 8.323
?-?-? 117.003 6.950 8.323
?-?-? 117.003 8.604 8.323
?-?-? 125.631 8.323 8.604
?-?-? 125.299 4.430 8.957
?-?-? 125.299 0.004 8.957
?-?-? 125.299 8.789 8.957
?-?-? 125.741 8.957 8.789
?-?-? 110.957 4.262 7.386
?-?-? 118.445 4.262 9.275
?-?-? 110.957 0.658 6.675
?-?-? 118.172 0.658 7.861
?-?-? 128.345 4.697 8.550
?-?-? 128.345 2.135 8.550
?-?-? 128.345 7.386 8.550
?-?-? 110.957 8.550 7.386
?-?-? 128.345 6.675 8.550
?-?-? 110.957 8.550 6.675
?-?-? 128.345 9.275 8.550
?-?-? 118.445 8.550 9.275
?-?-? 128.345 0.004 8.550
?-?-? 110.957 4.408 7.386
?-?-? 110.957 0.280 7.386
?-?-? 121.088 0.280 8.323
?-?-? 125.741 1.510 8.789
?-?-? 110.957 1.365 7.386
?-?-? 121.088 2.660 8.323
?-?-? 116.088 7.386 8.148
?-?-? 110.957 8.148 7.386
?-?-? 116.088 4.825 8.148
?-?-? 116.088 6.811 8.148
?-?-? 110.957 1.742 7.386
?-?-? 110.957 1.742 6.675
?-?-? 124.210 1.742 8.450
?-?-? 110.957 4.902 7.386
?-?-? 110.957 8.854 7.386
?-?-? 118.580 7.386 8.854
?-?-? 110.957 6.811 7.386
?-?-? 110.957 0.004 7.386
?-?-? 110.957 4.043 7.386
?-?-? 110.957 0.577 7.386
?-?-? 110.957 4.902 6.675
?-?-? 110.957 8.854 6.675
?-?-? 118.580 6.675 8.854
?-?-? 110.957 6.811 6.675
?-?-? 110.957 0.004 6.675
?-?-? 110.957 4.043 6.675
?-?-? 110.957 1.616 6.675
?-?-? 110.957 0.658 6.675
?-?-? 110.957 0.577 6.675
?-?-? 114.385 4.825 7.016
?-?-? 111.508 4.825 8.098
?-?-? 114.385 4.099 7.565
?-?-? 114.385 1.423 7.565
?-?-? 114.385 4.263 7.565
?-?-? 114.385 2.017 7.565
?-?-? 114.385 4.515 7.565
?-?-? 114.385 3.712 7.565
?-?-? 114.385 3.905 7.565
?-?-? 114.385 8.098 7.565
?-?-? 111.508 7.565 8.098
?-?-? 114.385 3.975 7.565
?-?-? 114.385 4.294 7.565
?-?-? 114.385 8.450 7.565
?-?-? 124.210 7.565 8.450
?-?-? 114.385 6.811 7.565
?-?-? 114.385 6.472 7.565
?-?-? 114.385 3.712 7.016
?-?-? 114.385 3.905 7.016
?-?-? 114.385 8.098 7.016
?-?-? 111.508 7.016 8.098
?-?-? 114.385 8.450 7.016
?-?-? 124.210 7.016 8.450
?-?-? 114.385 4.902 7.016
?-?-? 114.385 8.854 7.016
?-?-? 118.580 7.016 8.854
?-?-? 114.385 6.811 7.016
?-?-? 111.971 8.450 8.338
?-?-? 124.210 8.338 8.450
?-?-? 124.210 4.515 8.450
?-?-? 124.210 3.712 8.450
?-?-? 124.210 3.905 8.450
?-?-? 111.508 4.902 8.098
?-?-? 111.508 1.223 8.098
?-?-? 111.508 6.811 8.098
?-?-? 124.210 4.796 8.450
?-?-? 124.210 2.895 8.450
?-?-? 124.210 6.811 8.450
?-?-? 118.580 0.004 8.854
?-?-? 118.159 2.895 8.017
?-?-? 118.445 8.789 9.275
?-?-? 125.741 9.275 8.789
?-?-? 118.445 6.714 9.275
?-?-? 118.445 3.738 9.275
?-?-? 118.445 1.155 9.275
?-?-? 125.631 0.633 8.604
?-?-? 125.631 6.950 8.604
?-?-? 115.065 6.950 8.623
?-?-? 115.915 6.530 7.218
?-?-? 121.184 2.660 9.322
?-?-? 121.976 10.207 9.110
?-?-? 115.172 9.110 10.207
?-?-? 125.145 2.120 9.593
?-?-? 121.797 7.154 8.763
?-?-? 105.470 8.763 7.154
?-?-? 121.797 3.927 8.763
?-?-? 121.797 6.719 8.763
?-?-? 117.436 4.373 8.643
?-?-? 125.145 2.486 9.593
?-?-? 105.470 9.100 7.154
?-?-? 119.799 7.154 9.100
?-?-? 105.470 5.257 7.154
?-?-? 105.470 5.523 7.154
?-?-? 117.436 5.075 8.643
?-?-? 119.799 4.540 9.100
?-?-? 119.799 0.764 9.100
?-?-? 119.799 5.523 9.100
?-?-? 119.799 6.511 9.100
?-?-? 119.799 6.719 9.100
?-?-? 117.436 1.675 8.643
?-?-? 120.718 10.048 7.945
?-?-? 130.256 7.945 10.048
?-?-? 120.718 6.719 7.945
?-?-? 130.256 1.618 10.048
?-?-? 130.256 1.546 10.048
?-?-? 104.319 0.539 7.159
?-?-? 104.319 0.389 7.159
?-?-? 103.446 1.522 9.048
?-?-? 117.436 6.719 8.643
?-?-? 117.436 4.822 8.643
?-?-? 117.436 3.690 8.643
?-?-? 125.145 6.511 9.593
?-?-? 125.145 6.719 9.593
?-?-? 113.907 2.709 8.009
?-?-? 125.145 10.207 9.593
?-?-? 115.172 9.593 10.207
?-?-? 125.145 5.383 9.593
?-?-? 115.172 8.623 10.207
?-?-? 115.065 10.207 8.623
?-?-? 115.172 6.706 10.207
?-?-? 115.065 8.721 8.623
?-?-? 118.122 8.623 8.721
?-?-? 118.122 5.221 8.721
?-?-? 118.122 1.750 8.721
?-?-? 121.299 3.694 9.016
?-?-? 121.299 3.810 9.016
?-?-? 107.855 1.554 7.553
?-?-? 118.159 2.093 8.017
?-?-? 123.777 2.093 7.406
?-?-? 118.159 3.278 8.017
?-?-? 118.159 2.756 8.017
?-?-? 123.777 2.682 7.406
?-?-? 120.591 4.483 7.984
?-?-? 123.777 7.302 7.406
?-?-? 123.777 7.984 7.406
?-?-? 120.591 7.406 7.984
?-?-? 123.777 0.527 7.406
?-?-? 110.346 7.302 7.583
?-?-? 110.346 7.074 7.583
?-?-? 110.346 0.527 7.583
?-?-? 110.346 0.005 7.583
?-?-? 124.604 4.381 7.780
?-?-? 118.449 6.991 8.370
?-?-? 118.941 6.991 8.450
?-?-? 118.449 7.302 8.370
?-?-? 121.028 7.302 8.289
?-?-? 120.591 0.005 7.984
?-?-? 112.363 4.848 6.905
?-?-? 114.973 4.848 7.852
?-?-? 114.973 2.568 7.852
?-?-? 115.915 0.963 7.218
?-?-? 115.915 7.852 7.218
?-?-? 114.973 7.218 7.852
?-?-? 115.915 0.005 7.218
?-?-? 124.604 2.525 7.780
?-?-? 119.793 3.133 8.406
?-?-? 124.604 8.406 7.780
?-?-? 119.793 7.780 8.406
?-?-? 124.604 1.300 7.780
?-?-? 124.604 0.005 7.780
?-?-? 114.973 3.484 7.852
?-?-? 123.211 3.484 7.602
?-?-? 114.702 3.484 7.631
?-?-? 123.211 0.963 7.602
?-?-? 119.793 0.963 8.406
?-?-? 114.702 0.963 7.631
?-?-? 114.973 1.734 7.852
?-?-? 114.973 8.406 7.852
?-?-? 119.793 7.852 8.406
?-?-? 120.726 1.300 8.092
?-?-? 120.044 3.562 8.008
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