P.S.: you are not alone having such R-factors

On Fri, Apr 12, 2013 at 9:50 AM, Jan van Agthoven <[log in to unmask]> wrote:

Could this be due to an excessive low R
factor that phenix.refine has generated: R=17.9 and Rfree=23.3 at a
resolution of 2.85 A?

Histogram of Rwork for models in PDB at resolution 2.75-2.95 A:

     0.134 - 0.157      : 10

     0.157 - 0.180      : 75    <<<<< your model

     0.180 - 0.203      : 365

     0.203 - 0.226      : 666

     0.226 - 0.249      : 653

     0.249 - 0.272      : 247

     0.272 - 0.295      : 52

     0.295 - 0.318      : 11

     0.318 - 0.341      : 1

     0.341 - 0.364      : 1

Histogram of Rfree for models in PDB at resolution 2.75-2.95 A:

     0.191 - 0.210      : 27

     0.210 - 0.230      : 105

     0.230 - 0.249      : 271 <<<<< your model

     0.249 - 0.269      : 472

     0.269 - 0.288      : 649

     0.288 - 0.308      : 377

     0.308 - 0.328      : 129

     0.328 - 0.347      : 34

     0.347 - 0.366      : 14

     0.366 - 0.386      : 3

Histogram of Rfree-Rwork for all model in PDB at resolution 2.75-2.95 A:

     0.001 - 0.011      : 23

     0.011 - 0.021      : 87

     0.021 - 0.030      : 195

     0.030 - 0.040      : 377

     0.040 - 0.050      : 407

     0.050 - 0.060      : 408 <<<<< your model

     0.060 - 0.070      : 296

     0.070 - 0.079      : 162

     0.079 - 0.089      : 81

     0.089 - 0.099      : 45

Number of structures considered: 2081

The above histograms were obtained using command:

phenix.r_factor_statistics 2.85

Pavel