Print

Print


Hi Terri,

I do not know what a 'parcel' is in this context, but moving an image (ROI?) from MNI space brain to someones (person X) native brain space requires the following (assuming you have a T1 scan from person X):

1. make sure the image ('parcel'?) is registered correctly to MNI space.
2. segment the native space T1 of person X
3. choose normalize (write only), choose the image ('parcel') you want to unnormalize, choose as parameters the mat file with _inv.mat at the end that is produced during step 2 in the folder holding the T1, and run it.

Done.

Good luck,

Bas

On 11/15/2012 12:50 AM, Terri Scott wrote:
[log in to unmask]" type="cite"> Hi all, 

I need to move parcels from mni space into the subjects' native spaces. How would I do this? I'm very new to SPM.

Any advice is appreciated!

Thanks,
Terri


-- 
--------------------------------------------------
Dr. S.F.W. Neggers
Division of Brain Research
Rudolf Magnus Institute for Neuroscience
Utrecht University Medical Center

Visiting : Heidelberglaan 100, 3584 CX Utrecht
           Room B.01.1.03
Mail     : Huispost B01.206, P.O. Box 85500
           3508 GA Utrecht, the Netherlands
Tel      : +31 (0)88 7559609
Fax      : +31 (0)88 7555443
E-mail   : [log in to unmask]
Web      : http://www.neuromri.nl/people/bas-neggers
         : http://www.brainsciencetools.com (CEO)
--------------------------------------------------

De informatie opgenomen in dit bericht kan vertrouwelijk zijn en is uitsluitend bestemd voor de geadresseerde. Indien u dit bericht onterecht ontvangt, wordt u verzocht de inhoud niet te gebruiken en de afzender direct te informeren door het bericht te retourneren. Het Universitair Medisch Centrum Utrecht is een publiekrechtelijke rechtspersoon in de zin van de W.H.W. (Wet Hoger Onderwijs en Wetenschappelijk Onderzoek) en staat geregistreerd bij de Kamer van Koophandel voor Midden-Nederland onder nr. 30244197.

Denk s.v.p aan het milieu voor u deze e-mail afdrukt.


This message may contain confidential information and is intended exclusively for the addressee. If you receive this message unintentionally, please do not use the contents but notify the sender immediately by return e-mail. University Medical Center Utrecht is a legal person by public law and is registered at the Chamber of Commerce for Midden-Nederland under no. 30244197.

Please consider the environment before printing this e-mail.