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Hi Stephen, please check the links in CCP4 wiki at http://strucbio.biologie.uni-konstanz.de/ccp4wiki/index.php/Structure_based_sequence_alignment best, Kay -- Kay Diederichs http://strucbio.biologie.uni-konstanz.de email: [log in to unmask] Tel +49 7531 88 4049 Fax 3183 Fachbereich Biologie, Universität Konstanz, Box M647, D-78457 Konstanz