Print

Print


Okay, try "processors" and "slots" both equal to 2.

"processors=1,2" seems to be interpreted as "processors=1" - this needs to reflect the number of cores available so that SGE can calculate loads correctly.
"slots=1" means only 1 managed long.q process at a time - and you would like 2 presumably.

On 13 Sep 2007, at 12:53, Martin Kavec wrote:

Hi Dave,

have you been able to find anything wrong in my settings? Thanks a lot.

Martin

On Wednesday 12 September 2007 12:53:24 Martin Kavec wrote:
Hi Dave,

the outputs are below. Thanks.

Martin

On Wednesday 12 September 2007 12:02:31 Dave Flitney wrote:
Could you send me the output of the following commands:

qconf -sconf

$ qconf -sconf
global:
execd_spool_dir              /opt/SGE/default/spool
mailer                       /usr/bin/mail
xterm                        /usr/X11R6/bin/xterm
load_sensor                  none
prolog                       none
epilog                       none
shell_start_mode             posix_compliant
login_shells                 sh,ksh,csh,tcsh
min_uid                      0
min_gid                      0
user_lists                   none
xuser_lists                  none
projects                     none
xprojects                    none
enforce_project              false
enforce_user                 auto
load_report_time             00:00:40
max_unheard                  00:05:00
reschedule_unknown           00:00:00
loglevel                     log_warning
administrator_mail           [log in to unmask]
set_token_cmd                none
pag_cmd                      none
token_extend_time            none
shepherd_cmd                 none
qmaster_params               none
execd_params                 none
reporting_params             accounting=true reporting=false \
                                        flush_time=00:00:15 joblog=false
sharelog=00:00:00
finished_jobs                100
gid_range                    20000-20100
qlogin_command               telnet
qlogin_daemon                /usr/libexec/telnetd
rlogin_daemon                /usr/libexec/rlogind
max_aj_instances             2000
max_aj_tasks                 75000
max_u_jobs                   0
max_jobs                     0
auto_user_oticket            0
auto_user_fshare             0
auto_user_default_project    none
auto_user_delete_time        86400
delegated_file_staging       false
reprioritize                 0

qconf -sq long.q

$ qconf -sq long.q
qname                 long.q
hostlist              erasme52185.erasme.ulb.ac.be
seq_no                0
load_thresholds       np_load_avg=1.75
suspend_thresholds    NONE
nsuspend              1
suspend_interval      00:05:00
priority              0
min_cpu_interval      24:00:00
processors            1,2
qtype                 BATCH INTERACTIVE
ckpt_list             NONE
pe_list               make
rerun                 FALSE
slots                 1
tmpdir                /tmp
shell                 /bin/sh
prolog                NONE
epilog                NONE
shell_start_mode      posix_compliant
starter_method        NONE
suspend_method        NONE
resume_method         NONE
terminate_method      NONE
notify                00:00:60
owner_list            NONE
user_lists            NONE
xuser_lists           NONE
subordinate_list      NONE
complex_values        NONE
projects              NONE
xprojects             NONE
calendar              NONE
initial_state         default
s_rt                  INFINITY
h_rt                  INFINITY
s_cpu                 INFINITY
h_cpu                 INFINITY
s_fsize               INFINITY
h_fsize               INFINITY
s_data                INFINITY
h_data                INFINITY
s_stack               INFINITY
h_stack               INFINITY
s_core                INFINITY
h_core                INFINITY
s_rss                 INFINITY
h_rss                 INFINITY
s_vmem                INFINITY
h_vmem                INFINITY

qconf -ss

$ qconf -ss
erasme52185.erasme.ulb.ac.be

qconf -sel

$ qconf -sel
erasme52185.erasme.ulb.ac.be

--
Cheers, Dave

Dave Flitney, IT Manager
Oxford Centre for Functional MRI of the Brain
E:[log in to unmask] W:+44-1865-222713 F:+44-1865-222717