Dear SPMers,

I just tried to compile SPM binaries for my 64bit Ubuntu Linux system that runs matlab2007a. Using make at /spm5/src results in an error about an implicit declaration of the function “floor” in spm_vol_utils.c

Sorry, I only got the German version of the error since my compiler is in German.

root@earth:/usr/local/spm5/src# make

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        Linux compilation (x86-64) - using gcc

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gcc -c -O3 -funroll-loops -fPIC -march=x86-64 -mfpmath=sse -o utils_uchar.mexa64.o spm_vol_utils.c -DSPM_UNSIGNED_CHAR

spm_vol_utils.c:239:18: error: math.h: No such file or directory

spm_vol_utils.c:240:20: error: stdlib.h: No such file or directory

spm_vol_utils.c: In Funktion »resample_uchar_0«:

spm_vol_utils.c:257: Warnung: Unverträgliche implizite Deklaration der eingebauten Funktion »floor«

spm_vol_utils.c: In Funktion »resample_uchar_1«:

spm_vol_utils.c:290: Warnung: Unverträgliche implizite Deklaration der eingebauten Funktion »floor«

spm_vol_utils.c: In Funktion »resample_d_uchar_1«:

spm_vol_utils.c:335: Warnung: Unverträgliche implizite Deklaration der eingebauten Funktion »floor«

spm_vol_utils.c: In Funktion »slice_uchar_0«:

spm_vol_utils.c:535: Warnung: Unverträgliche implizite Deklaration der eingebauten Funktion »floor«

spm_vol_utils.c: In Funktion »slice_uchar_1«:

spm_vol_utils.c:590: Warnung: Unverträgliche implizite Deklaration der eingebauten Funktion »floor«

spm_vol_utils.c: In Funktion »slice_uchar«:

spm_vol_utils.c:719: Warnung: Unverträgliche implizite Deklaration der eingebauten Funktion »fabs«

spm_vol_utils.c:719: Warnung: Unverträgliche implizite Deklaration der eingebauten Funktion »floor«

make: *** [utils_uchar.mexa64.o] Fehler 1

I don’t know, what to do, since the compiler is installed correctly and the precompiled files that came with spm5 don’t work. For example Realign crashes with the error “Too many images”, when there is more than one image in the folder…

I hope, someone can help!

Florian Beißner

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Florian Beißner

Diplom-Physiker

Brain Imaging Center Frankfurt
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Tel: 069-6301-83820